中交武汉港湾工程设计研究院有限公司（简称“武港院”）成立于1960年，是中交二航局下属全资子公司。公司拥有水运设计（全行业）甲级、港口河海工程咨询甲级、建筑行业（建筑工程）乙级、公路养护工程施工从业一类、特种专业工程专业承包等资质，业务范围涵盖规划、工程咨询、工程设计、工程总承包、土木工程新材料研发、施工智能设备研发等。2007年，公司被认定为交通主管部门重点实验室；2008年起，连续12年被评为国家高新技术企业；2020年入选国务院国资委“科改示范行动”，致力于打造成为国有科技型企业改革样板和自主创新尖兵。

2020年，中交二航局为进一步打造高品质建筑业一体化服务商，全面提升策划、规划、勘察设计及咨询以及EPC等产业链前端与价值链高端能力，依托武港院部分设计咨询人员班底组建成立中交第二航务工程局有限公司设计研究院(简称“中交二航局设计研究总院”)，为中交二航局下属分公司。公司拥有水运行业甲级、公路行业甲级、市政行业甲级、岩土勘察乙级等多项资质，下设规划咨询院、公路设计院、市政设计院、水运设计院、建筑设计院，业务范围包含项目策划、城市规划、工程造价咨询服务、工程勘察设计、EPC项目设计管理等。公司积极发挥设计咨询在工程建设中的先导作用，树立二航设计品牌，力争打造成为“最懂客户需求，最懂工程施工，最会整合资源，最具创新精神”的综合型设计研究院!